À medida que a Guerra continua, Amuro e a tripulação da Base Branca têm de seguir em direção à sede da Federação Terrestre, Jaburo. Pelo caminho, encontram vários novos inimigos e enfrentam adversidades impossíveis. Lutam na Operação Odessa para libertar a Terra das garras das forças de Zeon. Perdem-se vidas, fazem-se novas amizades e surgem descobertas a cada esquina. Amuro depressa descobre que possui os poderes dos misteriosos Newtypes.